Первый пояс
Устанавливается зона санитарной охраны первого пояса исходя из защищенности источника водоснабжения - водоносного горизонта. Для защищенных водоносных горизонтов отсутствует вероятность загрязнения с поверхности, путем питания из вышележащих водоносных горизонтов, либо из гидравлически связанных поверхностных водотоков и водоемов граница зоны санитарной охраны артезианской скважины должна проходить в радиусе не менее 30 метров от нее. При расчетах скважин, обустроенных на незащищенные горизонты существует прямая опасность загрязнения подземных вод с поверхности радиус увеличивается до 50 метров. При отсутствии в непосредственной близости потенциальных источников загрязнения по согласованию с органами Роспотребнадзора возможно сокращение зоны санитарной охраны первого пояса в два раза: 15 и 25 метров.
В пределах этой зоны не должно находиться зданий, сооружений и других объектов, не относящихся к процессу извлечения, очистки, хранения и транспортировки воды.
Второй пояс
Служит для предвосхищения попадания в водозаборную скважину бактериального загрязнения посредством фильтрации подземных вод. Радиус этой зоны рассчитывается аналитически. Хотя расчет и имеет ориентировочный характер из-за сложности и динамичности гидродинамических процессов, тем не менее, органы Роспотребнадзора требуют точную цифру и жестко ориентируются на нее. Расчетная зависимость для зоны санитарной охраны выглядит следующим образом:

Элементы формулы радиуса зоны санитарной охраны второго пояса:
- расход (дебит) скважины, принимается как максимальный заявленный потребителем на расчетный срок эксплуатации;
- время выживания бактерий принимается весьма ориентировочно. Для второй климатической зоны принимается: 200 суток – для защищенных подземных вод (обычно напорные воды, имеющие водоупорную толщу над кровлей водоносного горизонта); 400 суток – для незащищенных подземных вод (грунтовые воды, или напорные водоносные горизонты, получающие питание из вышележащих горизонтов через литологические окна, либо имеющие прямую гидравлическую связь с поверхностными водами);
- мощность водоносного горизонта принимается как среднее значение по площади вокруг скважины;
- активная пористость принимается по архивным данным, для известняков Московской области обычно от 0,01 до 0,04.
- дебит скважины легко фиксируется и контролируется приборами учета; несоответствие фактического и заявленного дебита чаще всего не превышает 5%;
- время выживания бактерий принимается весьма условно и выбирается по двум критериям: климатическая зона, защищенность. Причем защищенность, в связи с высокой степенью неоднородности строения земных недр и динамичностью гидродинамических процессов оценивается субъективно на грубом качественном уровне;
- мощность водоносных горизонтов в большинстве случаев в Московской области выдержанная (в масштабе радиуса зоны санитарной охраны второго пояса). Точность оценки параметра зависит от степени изученности района расположения артезианской скважины;
- активная пористость пород, как было указано выше, принимается весьма ориентировочно (0,01-0,04 для известняков Московской области). То есть погрешность оценки может достигать 200% (занижение, или завышение в 2 раза). В этом случае радиус охранной зоны артезианской скважины может быть занижен, или завышен в 1,4 раза, так как значение активной пористости находится под корнем квадратным в исходном уравнении.
Поверхностный анализ показывает, что суммарная погрешность в оценке радиуса зоны санитарной охраны второго пояса может превышать 200-300%. Плюс ориентировочный характер самой формулы, которая сильно упрощает гидродинамические условия эксплуатации скважины.
Третий пояс
Зона санитарной охраны третьего пояса рассчитывается по схожей формуле, отличие заключается в замене времени выживания бактерий на расчетное время эксплуатации скважины. При расчете радиуса зоны санитарной охраны третьего пояса имеют место те же погрешности, что и для второго пояса.